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深国交SCIE斩获国际基因工程机器大赛(iGEM)全球亚军!

385 人参与  2020年11月25日 23:07  分类 : 学在深国交  评论

11月中旬,在2020新冠影响下的前所未有的Virtual iGEM Jamboree正式拉开帷幕。Poster展示,评委Q&A答辩,再到之后的finalist名单公布和award ceremony,Greatbay_SCIE无疑是这场角逐的一匹黑马,成功斩获全球第二(1st runner up),最佳硬件、模型等四种奖项,以及项目金奖!

想要加入GreatBay SCIE 2021,可以在文章末尾查看招新信息~

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Q&A至凌晨后的合影

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什么是iGEM?

iGEM=International Genetically Engineered Machine Competition

国际基因工程机器大赛(简称 iGEM),由麻省理工学院(MIT)于2003年创办,2005年发展成为国际性学术竞赛,是合成生物学领域的最高国际性学术竞赛。

竞赛内容十分灵活,每个队伍自行brainstorm项目主题并付诸实践,体验为期一年的科研经历。

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国际名校(麻省理工、哈佛、剑桥等)以及国内名校(北大、清华、复旦等)每年都组队参加,国内高中生参与iGEM的人数逐年增加。

2020年由于新冠疫情,iGEM组委会第一次尝试线上jamboree的形式,并获得了极大的成功。各种前所未有的形式涌现,如计入评奖的两次视频--promotion video(宣传视频)和presentation video(项目展示视频),一改往年单一的展现形式。

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入围finalist时全球播放的promotion video

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国交化学老师Jeff为presentation video提建议

高中、本科、研究生团队同台竞技,统一标准,不同奖池。奖项设置有:Finalist(决赛入围:高中生组两个队,本科组三个队,研究生组两个队),Grand Prize(冠军:每个组别一个队),Medals(金银铜奖:达到相关要求就可以获得),Special Award (单项奖冠军:某一个方面做的最好的队伍获得的,高中组总共有16个单项奖),Special Award Nomination(单项奖提名:每个奖项会有1-5个队伍被提名,单项奖冠军是在所有被提名的队伍里挑选的)。

今年GreatBay_SCIE成功斩获四项单项奖,分别是:

  • Best wiki

  • Best hardware

  • Best model

  • Best integrated human practice

以及项目金奖

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Greatbay_SCIE获得Best wiki


同时,我们的项目也获得了金奖

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我们,Greatbay_SCIE



Shroom sweeper


炎炎夏日,雨水充沛,2020年的夏天悄然来临。云南的野蕈在大自然的润泽下野生野长,成为了当地人民以及整个中国人民的美味佳肴。但是,噩耗接连传来:云南一家三口误食毒蘑菇,抢救无效身亡;永州一名男子采食几种蘑菇后出现症状,医院难以诊断,凶多吉少...仅云南一省,5-7月的蘑菇中毒人数例居然超过全省的新冠肺炎感染者

看似可爱的蘑菇,居然是一个潜在的杀手

通过近一步调研,我们发现的确不能责备当地人鉴别蘑菇的经验不足:很多毒蘑菇并不是想象中的颜色鲜艳,而是伪装成食用蘑菇的样子

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  橙盖鹅膏(无毒)  致命鹅膏(剧毒)

现有的毒素检测的方法,如LC-MS,ELISA和ELONA等,都需要以小时计的时间来进行毒素的检测。同时它们成本颇高、对实验器材要求严格,事前预防事后诊断都存在困难。

因此我们计划制作一种能够高效地对鹅膏毒素amatoxin进行检测的装置,集便携、便宜、迅速三大优点于一身。根据调查,我们打算使用将侧流免疫层析(LFIA,Lateral flow immunoASsay)与核酸适配体(APtamer)结合而成的全新ALFA(Aptamer lateral Flow Assay)技术。

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同时,我们希望通过单链抗体scFv(single-chain antIBody fragment)技术优化amatoxin毒素的抗体生产,使其不依赖哺乳动物的生产系统,降低成本。

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最后,我们将利用RPA技术使得检测的结果增强检测灵敏度,并设计一个手机软件对结果进行定量测量及分析,最后利用滑动芯片和试纸技术包装硬件。这项技术有希望扩展为针对多种包含植物毒素进行综合检测的的toolbox。

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硬件3D模型展示

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工具盒展示


暑假


进驻实验室


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暑假,我们正式进驻蓝晶实验室,15个人还处在破冰期,气氛有些尴尬。一进来,我们就发现自己的项目有些不一样:我们既没有很多传统的生物克隆,又很少养菌、接种,总之一切实验室公用区域的常用试剂,我们都用不上。同时,我们的核心实验都是领域前沿研究,很多protocol都需要自己摸索、创造。

实验室的老师不禁吐槽:

设想是不错,但是这个,更适合研究生做吧?

在等待我们专属实验材料到达的时候,我们率先开始了dry lab进程:建立专属于自己的wiki,模型,做市场调查...这些为我们后面繁多的ddl做了很好的准备!

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问卷结果


连线文献作者进行研讨

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七月初,焦虑与好奇并存的我们,终于开始了真正的实验室生(zhe)活(mo)---我们的实验失败率非常高,由于原理复杂,有的时候也无从debug。

我们只能一边依靠高糖奶茶的sugar rush安抚心灵,一边与那些难以直观控制的微观分子们过招。

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直到暑假结束,我们的阳性实验结果才陆续出现,给处在课业和实验双重压力下的我们吃了一颗定心丸。算了算,自从8月中旬开学以来,我们连续11个周末都泡在实验室,国庆假期更是一天不差的996工作,只为了不断尝试、改进,无论是基础实验还是硬件。

iGEM实验是会上瘾的。起先,在seniors们提出iGEMer至少有70%的课外时间要给我们的项目时,大家还曾担心、焦虑,生怕我们无法适应锐减的娱乐时间。然而,真正进入了实验室生活模式,iGEM、Shroom Sweeper(我们的项目名)反而成为了生活常态。一个接一个的实验其实是有内部推进逻辑的,而为了它们,大多数人都愿意花费几乎100%的课余时间。

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开学后的强阳性数据,黄得发光


ddl fighters


十月,本是一年中难得的气温黄金期,既不燥,也不寒。然而,对于iGEM而来说,心里时而火烧火燎,时而凉意嗖嗖。

ddl们接踵而至,十月是爆肝的一月。

最先截止的是promotion video,谁也没想到,仅2分钟的宣传视频居然需要几十个镜头机位切换和无数次排练。我们做了一个以Frozen II主题曲show your self为背景音乐的parady,将歌词改编成了iGEM版本。然而,就在ddl当天,我们考虑到使用迪士尼音乐可能存在的版权问题,并且当机立断做了一个决定:换曲调。

于是,就有了我们传奇7小时极限作曲,并压线过关的故事。

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之后就是最为紧张的wiki freeze,大家都分散在网页各处找🐛(debug),优化页面质量,并且在一天之内创建了内容丰富的硬件页面(并获得best hardware)。看着我们loading页面小蘑菇的动画,莫兰迪色调的主页和精致的页面设计、内容---爆肝,也值得啊....

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Poster freeze和presentation video freeze仿佛就在瞬息之间,但是在一个可靠的团队,合作就像是:当一个人在emotional breakdown的边缘,ta可以暂时退居二线,后面的人自然会补上来,整体进度不落。准备完ddl们,我们就迎来了最后的挑战:Q&A session,与评委进行深度的、长达20分钟的答辩。

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嘴上说着不慌,但是我们还是进行了充分的排练、搜寻问题以及预答辩等准备工作。我们的底气就是:所有工作,从前期brainstorm,调研啃文献,撰写立项报告书,再到后面的数学建模、市场调查,乃至实验设计、实验操作,都是我们一步一个脚印走过来的。自力更生,自给自足,再加上学识丰富的老师们不时指点--别问,问就是稳了。

当天晚上,答辩超常发挥,队员之间配合非常默契,一步步对抛出的问题进行逻辑加码,最终获得了评委一步步升级的好评。


Nice.

Awesome.

Perfect!

Congratulations!!!

我们一向淡定的指导老师也喊出了声:

这是我见过最完美的答辩!!!!!!

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Virtual Jamboree合影


写在最后

iGEMer的一些想法

Katherine Wang

iGEM 2020 GreatBay SCIE队长

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iGEM的体验是人生一大幸事,真的太值得了。很多人吐槽iGEM把人逼成了生物人、建模人、程序员、实验室工具人(误)、美工人、音乐人等等,但是这一切仿佛都是自然习得的。我们都不再斤斤计较时间成本,不再将任务当成额外负担,因为已经全(深)情(陷)投(其)入(中)了。

在在一个有内聚力的队伍,做着自己喜欢而对社会也有意义的事,也大概找到了自己的“ikigai”。

一年下来,去实验室的路无比熟悉,那是我度过几乎整个暑假和大部分周末的地方。真的很喜欢这种和大家一起为了同一个目标奋斗的感觉,即使我们最终获得的宝藏并不在于比赛这个目标本身(不过有好成绩还是很开心的awww)。

感谢iGEM,感谢GreatBay SCIE,感谢蓝晶实验室,感谢自己一年前做的那个英明决定和之后的进取。iGEMer forever!

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Chloe Ou

iGEM 2020 GreatBay SCIE队员

真的很开心,很幸运,就是没有说出“只要最后是你就好”这样的话,也觉得太开心了。真的很少有我们这么幸运的队伍吧,我们的队友父母老师还有很多让我们白嫖的人,真的太感谢了!

在一整个暑假和每个周末都呆在实验室的生活里,有时做实验都做得莫得感情了,也有好多次,感到迷茫绝望,对于未来什么都不敢想,只是继续做下去罢了。刚开始drylab的时候真的觉得我们是天下第一的队伍吧,只是不断经过实验的打击才接受了失败的常态。有谁能想象每天叫嚣着自己要拿大奖和所有单项奖的队伍,有一天也要坐在烘干箱前哭呢。

可是尽管像坐过山车这样的经过了这么多次,我们还是一次次地在绝望和希望中反复横跳,最后勉强爬起来。一个队伍就是可以走得这么远啊。

Shroom Sweepers冲!


Ginny Fan

iGEM 2020 GreatBay SCIE队长

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从6月份开始就没睡过一个好觉 在夜晚的实验室情绪崩溃坐在烘箱前面哭 很多次实验毫无进展 无数次怀疑自己适不适合做科研适不适合学生物 一边panic一边写wiki...

But the result is worth the effort.

还没来深国交的时候看到校刊上的iGEM校队 从当时开始就非常想来

初中的时候从未想过自己也能坐在实验室里 分子克隆 蛋白纯化 搞抗体 筛aptamer 做检测 真真切切的为更美好的未来出一分力 

更没有想过能遇到这么好的一群人 与他们一起做出了“the very first Aptamer Lateral Flow Assay for amanitin in the whole world”

两年iGEM 是结束也是开始

我们都有光明的未来🌟


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Winnie He

iGEM 2020 GreatBay SCIE队长

这一年很特别

是因为Covid去不了波士顿的一年

是只能从暑假开始做实验的一年

是连麦会议开的比线下会议多的一年

也是立项超有意思的一年

是认识了很多有趣的人的一年

是超有团魂的一年

Q&A的时候judges问你们最大的challenge

这个问题我们之前居然因为challenge太多而争论过哪个最惨

好可惜今年不能再去jamboree现场跟Lambert的同学学joggle

但是线上的jamboree也很快乐!!

被没空调的卫星大厦闷的不行

顺利QA完因为太开心了集体欢呼被隔壁队问是不是地震了(xs

虽然错失Grand Prize

但是这一切都是好特别的回忆啊

跟去年一样的:

iGEM is never just iGEM❤️


2021 GreatBay SCIE,等你来

iGEM 2021 招新!

不是所有的英雄都身着斗篷:大多数都穿着实验服。

iGEM - 国际基因工程机器大赛,全球合成生物学领域的最高赛事之一。

比赛项目为期一年——立项,大量文献阅读,长达半年的实验期,数学建模,软件硬件,公众教育,社会实践、商业计划…到最终在法国巴黎Jamboree的交流、答辩、颁奖…加入SCIE iGEM 2021,凭借高中生的力量推动生命科学的前沿。

加入SCIE iGEM 2021,用合成生物学找到对付能源、健康、环境危机的方法;重金属离子、毒素、有害气体的检测与清除;生产可降解塑料、治疗人类、动物和植物的疾病、除蚊、甚至帮助流浪猫…你的iGEM项目主题,只有想不到,没有做不到。

同时,iGEM是一个多学科交叉的赛事,有多方面的人才共同努力,才能做得更好。

(请各位生物人美工人CS人建模人商科人接受召唤!!)

SCIE iGEM 2021在此面向全校招生,只要你对合成生物学&基因编辑领域怀抱着热情,我们便欢迎你的到来。有意愿者加入下方负责人微信,会在招新群更新招新筛选具体信息

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本篇文章来源于微信公众号:  深国交

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